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服務(wù)篇 | 全基因組測序服務(wù)

來源: | 作者:/ | 發(fā)布時間: 2023-12-12 | 958 次瀏覽 | 分享到:


全基因組測序(Whole genome sequencing,WGS)是一種獲得物種基因組的整個編碼區(qū)(外顯子)和非編碼區(qū)的實(shí)驗(yàn)室技術(shù)。一次的測序?qū)嶒?yàn),可獲得相應(yīng)物種的全部基因信息:如單核苷酸多態(tài)性(SNP)、拷貝數(shù)變異(SNV)、插入缺失(Indel)等。這種測序方法在沒有參考基因組或者可參考基因組質(zhì)量較差時,發(fā)揮著重要的作用。


測序平臺




分析項(xiàng)目



基因結(jié)構(gòu)預(yù)測與功能注釋



測序數(shù)據(jù)質(zhì)控分析



高質(zhì)量基因組組裝



蛋白結(jié)構(gòu)注釋



重復(fù)序列分析



代謝功能注釋



其他個性化分析

         ......



測序優(yōu)勢


經(jīng)驗(yàn)加成

測序經(jīng)驗(yàn)豐富


報告周期短

最快7個工作日獲取測序報告


高準(zhǔn)確率

Raw read accuracy,

99.5%(Q23)


定制化測序方案

可根據(jù)實(shí)際需求制定個性化

測序方案


長度長測序

在基因組組裝、結(jié)構(gòu)變異、

表觀修飾等方面有很大優(yōu)勢



技術(shù)路線





建庫樣本要求


外觀

DNA樣本澄清透明,無雜質(zhì)、無粘稠現(xiàn)象。


OD值

260/280=1.8~2.0;

260/230≥2.0~2.2。


總量

總量≥2ug;

或濃度≥25ng/ul;

且總體積≥100ul;



圖片


[1] Nurk S, Koren S, Rhie A, et al. The complete sequence of a human genome. Science. 2022;376(6588):44-53.

[2] Li A, Liu A, Du X, Chen JY, Yin M, Hu HY, Shrestha N, Wu SD, Wang HQ, Dou QW, Liu ZP, Liu JQ, Yang YZ, Ren GP. A chromosome-scale genome assembly of a diploid alfalfa, the progenitor of autotetraploid alfalfa. Hortic Res. 2020 Dec 1;7(1):194.

[3] Xie G, Zhang X, Lv F, Sang M, Hu H, Wang J, Liu D. Nanopore Sequencing and Hi-C Based De Novo Assembly of Trachidermus fasciatus Genome. Genes (Basel). 2021 May 6;12(5):692.